在MySQL数据库中，主键是表中一行的唯一标识符，可以用来快速地检索和访问数据行。一般情况下，主键只有一个列，但有些情况下可能需要使用多个列来定义一个唯一键。这就是MySQL中的复合主键。使用复合主键会影响到查询的性能。

在查询数据时，MySQL会使用主键来快速地定位所需的数据行。如果使用复合主键，那么每个主键列都需要进行索引，而且查询语句中必须包含所有列。如果查询语句没有包含所有列，那么MySQL将无法使用索引，只能对整个表进行扫描来获取数据。这将导致查询的效率低下，并会消耗大量的资源。

SELECT * FROM table WHERE col1 = 'value1' AND col2 = 'value2';

在上面的查询语句中，如果col1和col2是复合主键的两个列，那么MySQL将使用这两个列的索引来定位数据行。如果只查询col1，那么MySQL将无法使用索引，只能扫描整个表来查找匹配的数据。

另外，使用复合主键会使索引的大小变大。每个索引都需要存储全部的组合值，而且在表中插入或修改数据时，还需要更新每个索引，这将降低写入的效率。

综上所述，使用复合主键对查询的影响很大，建议仅在必要时使用复合主键。如果有大量的不同查询需要使用复合主键，可以考虑使用单个主键并创建额外的索引来优化查询效率。