JavaScript中的Base64编码是将二进制数据以ASCII字符串形式进行传输和存储的一种方法。它可以将任意的二进制数据转化成纯文本，且转化后的文本数据只包含A~Z、a~z、0~9、+、/等字符，而且不会出现换行符或者其他特殊字符。在网络传输中，Base64编码可用于传送图片、音频、视频等多媒体文件。

Base64编码原理：

原始数据：Man
原始数据的二进制表示：01001101 01100001 01101110
将二进制数据按照6 bit拆分：010011 010110 000101 101100
将6 bit转化成相应的十进制数：19 22 5 44
将转化后的十进制数对应Base64编码表得到编码结果：T W F m
最终编码结果：TWFu

JavaScript在实现Base64编码时，需要借助btoa()和atob()方法。btoa()可以将任意字符串或二进制数据转换为Base64编码字符串，而atob()则是将经过Base64编码的字符串转换为原始字符串。

//将字符串编码为Base64字符串
var encodedString = btoa('hello world');
console.log(encodedString); //aGVsbG8gd29ybGQ=
//将Base64编码字符串解码为原始字符串
var originalString = atob(encodedString);
console.log(originalString); //hello world

当使用中文或其他非ASCII字符进行Base64编码时，需要注意使用双字节编码方案，如UTF-8。以下是将中文字符串转化为Base64编码的示例：

//将中文字符串编码为Base64字符串
var encodedString = btoa(unescape(encodeURIComponent('你好，世界')));
console.log(encodedString); //JUU0JUJEJUEwJUUxJUJBJUIwJUUxJUI4JUJBJUUwJUI1JTk2
//将Base64编码字符串解码为中文字符串
var decodedString = decodeURIComponent(escape(atob(encodedString)));
console.log(decodedString); //你好，世界

Base64编码在常见的Web应用中广泛使用，如将图片转换成Base64编码后，可以直接存储在CSS样式中，减少了HTTP请求次数；还可以将敏感数据进行加密处理，提高安全性。但是需要注意，Base64编码并不是加密，只是一种编码方式，如果需要更高的安全性，可以使用其他加密算法。