在使用PHP连接MySQL时，如果MySQL服务器不使用默认的3306端口号，则需要在连接字符串中指定端口号。

连接字符串的格式是：

$mysqli = new mysqli('host:port', 'username', 'password', 'database');

其中，host为MySQL服务器地址，port为服务器的端口号。

举个例子，如果MySQL服务器的IP地址为192.168.1.100，端口号为3307，用户名为root，密码为123456，需要连接的数据库为test，则连接字符串应该是：

$mysqli = new mysqli('192.168.1.100:3307', 'root', '123456', 'test');

当然，如果需要使用PDO连接MySQL，也可以使用类似的方式指定端口号：

$conn = new PDO('mysql:host=192.168.1.100;port=3307;dbname=test', 'root', '123456');

需要注意的是，如果MySQL服务器不在本地，还需要开启服务器的对外访问端口。