Java中的正则表达式（Regular Expression）是一个非常强大的工具，可以用于检查、匹配和替换文本中的字符序列。使用正则表达式，可以对字符串进行强大的模式匹配和文本处理。Java正则表达式是基于Perl 5正则表达式语法的实现，并且支持大多数Perl的正则表达式模式。

indexOf()是Java中字符串类中的一种方法，可以用来查找一个字符串中另一个字符串的位置。indexOf()方法返回的是字符串中第一次出现指定字符或字符串的位置。如果没有找到指定字符或字符串，则返回-1。

示例代码：
String str = "Hello World!";
//使用正则表达式在字符串中查找“o”
if(str.matches(".*o.*")) {
System.out.println("字符串中包含o");
}
//使用indexOf()方法在字符串中查找“o”所在的位置
int index = str.indexOf("o");
if(index != -1) {
System.out.println("o所在的位置是：" + index);
}

正则表达式在Java中的应用非常广泛，可以用来验证输入的数据是否符合规定的格式，比如邮箱、手机号码等。而indexOf()方法则可以用来在字符串中查找某个字符或字符串的位置，非常方便实用。